Ağız dokusu bütünlüğünün yaralar (mukozit) nedeniyle bozulması, enfeksiyonlara giriş yolu oluşturur ve bölgesel ya da tüm vücudu etkileyen enfeksiyonlara neden olabilir. En sık karşılaşılan enfeksiyon, beyaz süt kesiği görünümlü plaklar şeklinde ortaya çıkan mantar enfeksiyonlarıdır.

   

    Ayrıca uçuk virüsünün neden olduğu, içi sıvı dolu küçük kabarcık şeklinde doku değişiklikleri oluşabilir. Bu kabarcıklar daha sonra birleşerek yırtılır ve yaralar haline gelir.

   

    Kemoterapi sırasında vücut direncinin düşmesi nedeniyle hastanın ağzında önceden varolan diş ve diş eti enfeksiyonları da şiddetlenebilir. Diş etlerindeki enfeksiyonlar hastada kötü tat, ağrı, kanama gibi yakınmalar yaratabilir.